| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| aCGH | 简Fridlyand | 阵列比较基因组杂交数据的类和函数。 |
| affxparser | Kasper丹尼尔·汉森 | Affymetrix SDK文件解析 |
| affyio | 本杰明·米洛Bolstad | 解析Affymetrix数据文件的工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | GUI使用limma affy分析包 |
| ArrayExpress | 奥黛丽考夫曼 | 访问ArrayExpress微阵列数据库在EBI和构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch NChannelSet |
| beadarraySNP | 1月东 | 标准化和报告的Illumina公司SNP珠阵列 |
| codelink | 迭戈Diez | 操纵Codelink Bioarrays数据。 |
| ctc | 安东尼·卢卡斯 | 集群和树转换。 |
| exonmap | Crispin米勒 | 高水平的分析Affymetrix外显子数组的数据 |
| GeneRegionScan | Lasse Folkersen | GeneRegionScan |
| genomeIntervals | 朱利安Gagneur | 基因操作的间隔 |
| GEOquery | 肖恩·戴维斯 | 从NCBI基因表达综合(GEO)获得数据 |
| 帮助 | 里德·汤普森 | 帮助数据分析的工具 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | GUI对limma包 |
| makecdfenv | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 提供环境制造商 |
| 庄园 | 皮埃尔Neuvial | 全息微阵列正常化 |
| 益生元 | Benilton卡瓦略 | 低级的寡核苷酸阵列分析的工具。 |
| oneChannelGUI | 拉斐尔一Calogero | 这个包扩展affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3 '看,基因外显子数组实际上是实现togheter Illumina公司,GEO矩阵系列文件和标签分隔的文件。 |
| 林格 | j . Toedling | R调查ChIP-chip Oligoarrays |
| rtracklayer | 迈克尔•劳伦斯 | R接口基因组浏览器及其注释 |
| SAGx | 每Broberg | GeneChip的统计分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| xps | 基督教Stratowa | 处理和分析Affymetrix寡核苷酸阵列包括外显子数组,全基因组阵列和板阵列 |