| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| affycoretools | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 函数用于那些做重复性分析与Affymetrix GeneChips。 |
| AffyExpress | Xuejun阿瑟·李 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 选择提供环境(又名probeset映射) |
| annaffy | 科林·a·史密斯 | Affymetrix生物元数据注释工具 |
| 注释 | Biocore团队c / o BioC用户列表 | 注释的微阵列 |
| AnnotationDbi | Biocore团队c / o BioC用户列表 | 注释数据库接口 |
| annotationTools | 亚历山大·库恩 | 注释微阵列和执行跨物种基因表达分析使用平面文件数据库。 |
| arrayQualityMetrics | 奥黛丽考夫曼 | 质量标准在微阵列数据集 |
| ArrayTools | 亚瑟•李 | geneChip分析包 |
| biomaRt | 史蒂芬Durinck | 接口BioMart数据库(例如运用,Wormbase和Gramene) |
| 类别 | 罗伯特先生 | 类别分析 |
| domainsignatures | Florian Hahne | 基于InterPro Geneset浓缩域签名 |
| DynDoc | Biocore团队c / o BioC用户列表 | 动态文档工具 |
| ecolitk | 劳伦特 | 元数据和工具为大肠杆菌 |
| exonmap | Crispin米勒 | 高水平的分析Affymetrix外显子数组的数据 |
| 群 | 丹特南鲍姆 | 广播数据之间R和其他生物信息学计划 |
| gene2pathway | Holger Froehlich | 预测KEGG通路成员基于InterPro域的单个基因签名 |
| 总的来说 | y d 'Aubenton-Carafa | R基因和序列分析 |
| GeneRfold | 安东尼·卢卡斯 | R基因和序列,使用viennaRNA包(折叠) |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算全球测试组间差异基因表达 |
| globaltest | Jelle Goeman | 测试协会组织的基因与临床变量 |
| goProfiles | 亚历克斯·桑切斯 | goProfiles: R包统计分析功能的配置文件 |
| GOSemSim | Guangchuang余 | GO-terms语义相似性度量 |
| GOstats | 罗伯特先生 | 去微阵列的操作工具。 |
| goTools | 艾格尼丝Paquet | 功能基因本体数据库 |
| KEGGgraph | 张Jitao大卫 | KEGGgraph:图方法在R和Bioconductor KEGG通路 |
| keggorth | VJ凯里 | 图支持KO, KEGG Orthology |
| KEGGSOAP | 罗伯特先生 | 客户端SOAP访问KEGG |
| matchprobes | Biocore团队c / o BioC用户列表 | 基础设施使用寡核苷酸微阵列记者序列信息预处理和质量评估 |
| miRNApath | 詹姆斯·m·沃德 | miRNApath: microrna的表达数据的通路富集 |
| nem | 基督教本德 | 嵌套的效应模型重建表型层次结构 |
| occugene | 奥利弗将 | 函数多项式用房分布 |
| PAnnBuilder | 李红 | 蛋白质注释数据包生成器 |
| pdInfoBuilder | Benilton卡瓦略 | 平台设计信息包生成器 |
| qpgraph | 罗伯特Castelo | 逆向工程与qp-graphs的分子调控网络 |
| Resourcerer | Jianhua张 | 读取注释数据从TIGR Resourcerer或注释数据转换成pacakge Bioconductor数据。 |
| RNAither | 诺拉Rieber | 统计分析的高通量RNAi屏幕 |
| rtracklayer | 迈克尔•劳伦斯 | R接口基因组浏览器及其注释 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| xmapbridge | 蒂姆·耶茨 | 策划文件导出到xmapBridge X:可视化的地图 |
| yaqcaffy | 劳伦特与 | Affymetrix表达数据质量控制和再现性分析 |