nem

嵌套效应模型来重建表型层次结构

包'nem'允许从扰动效应的嵌套结构中重建路径的特征。它将(1.)一组被扰动的通路成分作为输入，(2.)这些扰动的高维表型读数(例如基因表达或形态谱)。输出是代表表型层次结构的有向图。

作者 Florian Markowetz, Holger Froehlich, Achim Tresch, Matthias Maneck, Claudio Lottaz, Tim Beissbarth
维护人员 Florian Markowetz

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite (nem)

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markowetz -论文- 2006. - pdf
嵌套效应模型——果蝇免疫反应的一个例子
参考手册
包的来源 nem_2.6.0.tar.gz
Windows二进制 nem_2.6.0.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 nem_2.6.0.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 nem_2.6.0.tgz
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细节

biocViews
微阵列，统计数据，GraphsAndNetworks，通路
取决于
R, e1071，图，Rgraphviz，RBGL，时间，集群，bootstrap, RColorBrewer, plotrix
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许可证 GPL (>= 2)
URL //www.anjoumacpherson.com
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