cosmo在一组未对齐的DNA序列中寻找共享的基序，例如，这些基序可能代表一个共同的转录因子结合位点。该算法类似于MEME，但也允许用户指定一组未知motif的位置权重矩阵必须满足的约束。例如，这些约束可能包括未知基序的某些区域的信息内容的界限，并且通常可以在有关相关转录因子结构的先验知识的基础上制定。未知的motif宽度、motif出现的分布(OOPS、ZOOPS或TCM)以及适当的约束集可以数据自适应地选择。
| 作者 | 奥利弗·本博姆，法比安·加卢瑟，桑德琳·杜多特 |
| 维护人员 | 奥利弗Bembom |
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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite (cosmo)
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R，方法，utils，seqLogo
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| 许可证 | 仅供研究使用。有关详细信息，请参见复制或在R中键入license.cosmo()。 |
| URL | http://cosmoweb.berkeley.edu/intro.html, http://www.bepress.com/sagmb/vol6/iss1/art8 |
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