SNPchip

类和方法对高吞吐量SNP芯片数据

这个包定义了策划类和函数拷贝数和高吞吐量的SNP基因型平台Affymetrix和Illumina公司等。特别是,SNPchip是一个有用的附加预处理后的可视化SNP-level益生元包估计。

作者 罗伯特·Scharpf和Ingo Ruczinski
维护人员 罗伯特Scharpf

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPchip”)

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参考手册
包的来源 SNPchip_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 SNPchip_1.6.0.zip
MacOS X 10.4(老虎)二进制 SNPchip_1.6.0.tgz
MacOS X 10.5(豹)二进制 SNPchip_1.6.0.tgz
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细节

biocViews
取决于
R,Biobase、方法、oligoClasses、图形
进口
建议
RSQLite,geneplotter、统计数据、图表、VanillaICE,RColorBrewer
系统需求
许可证 LGPL版本2或更新
URL http://www.biostat.jhsph.edu/ iruczins /软件/ snpchip.html
取决于我
进口我
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