该包用于检测微阵列芯片上的扩展,扩散和紧凑的瑕疵。Harshlight自动标记芯片集合中的区域(affybatch对象),并返回更正后的affybatch对象,其中有缺陷的区域用NAs或集合中其他芯片中相同探针值的中值代替。新版本将替换值作为整个矩阵处理,解决了内存问题。
作者 | Mayte Suarez-Farinas, Maurizio Pellegrino, Knut M. Wittkowski, Marcelo O. Magnasco |
维护人员 | 莫里吉奥Pellegrino |
要安装这个包,启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Harshlight”)
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许可证 | GPL版本2或更高版本 |
URL | http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/ |
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