Harshlight

一种微阵列芯片的“校正化妆”程序

该包用于检测微阵列芯片上的扩展,扩散和紧凑的瑕疵。Harshlight自动标记芯片集合中的区域(affybatch对象),并返回更正后的affybatch对象,其中有缺陷的区域用NAs或集合中其他芯片中相同探针值的中值代替。新版本将替换值作为整个矩阵处理,解决了内存问题。

作者 Mayte Suarez-Farinas, Maurizio Pellegrino, Knut M. Wittkowski, Marcelo O. Magnasco
维护人员 莫里吉奥Pellegrino

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Harshlight”)

文档

包下载

Harshlight
参考手册
包的来源 Harshlight_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 Harshlight_1.12.0.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 Harshlight_1.12.0.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 Harshlight_1.12.0.tgz
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许可证 GPL版本2或更高版本
URL http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/
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