| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| AffyExpress | Xuejun阿瑟·李 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | GUI使用limma affy分析包 |
| affyPLM | 本Bolstad | 方法拟合probe-level模型 |
| affyQCReport | 克雷格Parman | 为affyBatch对象QC报告生成 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 选择提供环境(又名映射) |
| arrayMvout | 诉凯利 | 多元异常值检测表达阵列QA |
| arrayQuality | 艾格尼丝Paquet | 数组质量评估发现数组 |
| arrayQualityMetrics | 奥黛丽考夫曼 | 质量标准在微阵列数据集 |
| ArrayTools | 亚瑟•李 | geneChip分析包 |
| beadarray | 马克·邓宁 | 质量评估和低级Illumina公司BeadArray数据分析 |
| 帮助 | 里德·汤普森 | 帮助数据分析的工具 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | GUI对limma包 |
| 庄园 | 皮埃尔Neuvial | 全息微阵列正常化 |
| 奥林 | 马提亚Futschik | 优化的本地intensity-dependent正常化双色微阵列 |
| OLINgui | 马提亚Futschik | 奥林的图形用户界面 |
| oneChannelGUI | 拉斐尔一Calogero | 这个包扩展affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3 '看,基因外显子数组实际上是实现togheter Illumina公司,GEO矩阵系列文件和标签分隔的文件。 |
| 罗摩 | 拉斐尔Gottardo | 强大的微阵列分析 |
| 林格 | j . Toedling | R调查ChIP-chip Oligoarrays |
| RNAither | 诺拉Rieber | 统计分析的高通量RNAi屏幕 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| spikeLI | 恩里科Carlon | Affymetrix激增朗缪尔等温线数据分析工具 |
| spotSegmentation | 克里斯Fraley | 微阵列点分割和网格块微阵列斑点 |
| yaqcaffy | 劳伦特与 | Affymetrix表达数据质量控制和再现性分析 |