包 | 维护人员 | 标题 |
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affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma包进行affy分析的GUI |
BGmix | 亚历克斯·列文 | 差异基因表达的贝叶斯模型 |
fdrame | 有效率切尼克斯贝格 | 微阵列实验FDR调整(FDR- ame) |
GOstats | 罗伯特先生 | 用于操作GO和微阵列的工具。 |
LBE | 西里尔Dalmasso | 错误发现率的估计。 |
limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
limmaGUI | 基斯Satterley | 用于limma包的GUI |
made4 | Aedin Culhane | 利用ADE4对微阵列数据进行多元分析 |
乘 | 凯瑟琳·s·波拉德 | 基于重采样的多重假设检验 |
OCplus | 亚历山大plone ( | 微阵列实验的操作特性、样本量和局部fdr |
oneChannelGUI | Raffaele A Calogero | 这个包扩展了affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3’IVT,基因外显子阵列实际与Illumina、GEO矩阵系列文件和制表符分隔文件一起实现。 |
OrderedList | 克劳迪奥·Lottaz | 有序基因表的相似性 |
拙劣的模仿 | VJ凯里 | 参数化和抗异常值检测 |
qvalue | 约翰·d·斯托里 | 错误发现率控制的q值估计 |
SAGx | 每Broberg | 基因芯片的统计分析 |
sigPathway | Weil赖 | 路径分析 |
《暮光之城》 | 斯蒂芬妮Scheid | 估计局部错误发现率 |