| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| AffyExpress | 李学军 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma包进行affy分析的GUI |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 备选CDF环境(又名映射) |
| ArrayTools | 亚瑟•李 | 基因芯片分析包 |
| BAC | 拉斐尔Gottardo | 芯片实验的贝叶斯分析 |
| BGmix | 亚历克斯·列文 | 差异基因表达的贝叶斯模型 |
| bgx | 欧内斯特Turro | 贝叶斯基因表达 |
| BicARE | Pierre Gestraud， | BicARE |
| 桥 | 拉斐尔Gottardo | 差异基因表达的贝叶斯鲁棒推理 |
| cellHTS | Ligia胸罩 | 细胞筛选分析 |
| cellHTS2 | Florian Hahne | 细胞筛选的分析。cellHTS的修订版 |
| 国王杯 | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 执行癌症异常值分析的功能。 |
| daMA | Jobst Landgrebe | 阶乘双色微阵列数据的高效设计与分析 |
| DEDS | 肖渊源 | 微阵列数据的距离汇总差分表达式 |
| DFP | 罗德里戈Alvarez-Glez | 基因选择 |
| diffGeneAnalysis | Choudary Jagarlamudi | 执行差异基因表达分析 |
| edd | 文斯凯里 | 表达密度诊断 |
| 刨边机 | 马克。罗宾逊 | R .基因数字表达数据的实证分析 |
| exonmap | Crispin米勒 | Affymetrix外显子阵列数据的高水平分析 |
| factDesign | 丹尼斯Scholtens | 析因设计微阵列实验分析 |
| fdrame | 有效率切尼克斯贝格 | 微阵列实验FDR调整(FDR- ame) |
| flowCore | Nolwenn Le Meur | flowCore:流式细胞仪数据的基本结构 |
| flowQ | 勒默尔 | 流式细胞仪的质量控制 |
| flowUtils | 作者Nishant葛 | 流式细胞仪实用程序 |
| flowViz | Florian Hahne | 流式细胞术可视化 |
| gaga | 大卫Rossell | 用于微阵列数据分析的GaGa层次模型 |
| GeneSelector | 马丁Slawski | GeneSelector |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算组间差异基因表达的全局测试 |
| globaltest | Jelle Goeman | 检测具有临床变量的基因组的关联 |
| 哼哼 | HyungJun曹 | 多条件下差异表达基因鉴别的异构误差模型 |
| lapmix | Yann Ruffieux | 微阵列实验中的拉普拉斯混合模型 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | 用于limma包的GUI |
| LMGene | 约翰·蒂 | 用于基因表达阵列中差异表达基因的数据转换和鉴定的LMGene软件 |
| logitT | 托拜厄斯Guennel | logit-t包 |
| 简述 | Nitin耆那教徒的 | 微阵列数据的局部合并误差分析方法 |
| maanova | Hyuna杨 | 分析微阵列实验的工具 |
| macat | Joern Toedling | 微阵列染色体分析工具 |
| maigesPack | Gustavo H. Esteves | 处理cDNA微阵列数据的功能，包括数据分析的几种方法 |
| maSigPro | 安娜Conesa | 时间过程微阵列数据中基因表达谱的显著差异 |
| MEDME | 马狄亚 | 来自MeDIP富集的模拟实验数据 |
| MergeMaid | 于宁波钟 | 合并女仆 |
| metaArray | 遭受崔 | 集成微阵列数据进行元分析 |
| miRNApath | 詹姆斯·m·沃德 | miRNApath: miRNA表达数据的富集途径 |
| 乘 | 凯瑟琳·s·波拉德 | 基于重采样的多重假设检验 |
| 推动 | n .院长 | 正态均匀差分基因表达检测 |
| OCplus | 亚历山大plone ( | 微阵列实验的操作特性、样本量和局部fdr |
| oneChannelGUI | Raffaele A Calogero | 这个包扩展了affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3’IVT，基因外显子阵列实际与Illumina、GEO矩阵系列文件和制表符分隔文件一起实现。 |
| OrderedList | 克劳迪奥·Lottaz | 有序基因表的相似性 |
| pcot2 | 莎拉的歌 | 主坐标和霍特林t平方法 |
| pickgene | Brian S. Yandell | 微阵列表达数据分析的自适应基因选择 |
| plgem | 马狄亚 | 幂律全局误差模型 |
| PLPE | Soo-heang Eo | 配对高通量数据差分表达式的局部合并误差检验 |
| plw | 马格努斯搁浅地 | 局部调节加权t检验。 |
| 普拉达 | Florian Hahne | 基于细胞功能分析的数据分析 |
| 彪马 | 理查德·皮尔森 | 微阵列分析中的传播不确定性 |
| RankProd | Fangxin香港 | 鉴别差异表达基因的秩积法及其在元分析中的应用 |
| rflowcyt | n LeMeur | 流式细胞分析的统计工具和数据结构 |
| rHVDM | 马蒂诺Barenco | 隐变量动态建模 |
| RNAither | 诺拉Rieber | 高通量RNAi筛选的统计分析 |
| 中华民国 | 文斯凯里 | ROC的实用程序，以uarray为焦点 |
| SAGx | 每Broberg | 基因芯片的统计分析 |
| siggenes | Holger Schwender | 使用SAM和Efron的经验贝叶斯方法进行多重测试 |
| sigPathway | Weil赖 | 路径分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| splicegear | Laurent Gautier | splicegear |
| sscore | 理查德•肯尼迪 | Affymetrix寡核苷酸微阵列的S-Score算法 |
| ssize | 格雷戈里·r·沃恩斯 | 估计微阵列样本量 |
| timecourse | 御川台 | 发育微阵列时间过程数据的统计分析 |
| 《暮光之城》 | 斯蒂芬妮Scheid | 估计局部错误发现率 |
| webbioc | 科林·a·史密斯 | Bioconductor Web界面 |
| XDE | 罗伯特Scharpf | XDE:用于差异基因表达交叉研究分析的贝叶斯层次模型 |