xps
非对称寡核苷酸阵列包括外显子阵列和基因阵列的处理和分析方法
该软件包处理Affymetrix GeneChip表达阵列的预处理，归一化，过滤和分析，包括外显子阵列系统(外显子1.0 ST:核心，扩展，完整探针)和基因阵列系统(基因1.0 ST)，只有1 GB内存的计算机。它导入Affymetrix . cdf， . clf， . pgf和. cel以及注释文件，并计算例如RMA, MAS5, DABG-calls。它是一个R包装到XPS(表达式分析系统)，这是基于ROOT，一个面向对象的框架在CERN开发。因此，优先安装ROOT是使用此包的先决条件，但是，不需要了解ROOT。ROOT是在LGPL下授权的，可以从http://root.cern.ch下载。
| 作者 |
Christian Stratowa，维也纳，奥地利 |
| 维护人员 |
基督教Stratowa |
要安装这个包，启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite (xps)
细节
| biocViews |
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| 取决于 |
R,方法 |
| 建议 |
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| 进口 |
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| SystemRequirements |
根< http://root.cern。ch> -请参阅README文件的安装说明。 |
| 许可证 |
GPL版本2或更新 |
| URL |
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| dependsOnMe |
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| suggestsMe |
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