vsn

微阵列数据方差稳定与校正

该软件包实现了参考文献中描述的微阵列数据随机模型的最大似然估计器的鲁棒变体。该模型包含数据校准(又名归一化)、方差对平均强度的依赖模型和方差稳定数据转换。转换强度之间的差异类似于“归一化对数比”。然而,与后者相比,它们的方差与均值无关,在检测差异转录时通常更敏感和特异。

作者 沃尔夫冈·胡贝尔,A. von Heydebreck贡献。其中包括Dennis Kostka、David Kreil、Hans-Ulrich Klein、Robert Gentleman、Deepayan Sarkar和Gordon Smyth等用户的许多评论和建议
维护人员 沃尔夫冈•休伯

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“vsn”)

小插曲(文档)

包下载

Rplots.pdf
convergence2.pdf
likelihoodcomputations.pdf
vsn.pdf
vsn_3.6.0.tar.gz
Windows二进制 vsn_3.6.0.zip
OS X二进制文件 vsn_3.6.0.tgz

细节

biocViews
取决于 R,方法,格子,生物基础,affy, limma
建议 Affydata, hgu95av2cdf, geneplotter
进口
SystemRequirements
许可证 艺术- 2.0
URL http://www.r-project.org, http://www.ebi.ac.uk/huber
dependsOnMe Ringo, arrayQualityMetrics, cellHTS2, tilingArray, webbioc
suggestsMe bichromodies, GlobalAncova, adSplit, beadarray, cellHTS, ecolitk, globaltest, limma, lumi, twilight