该软件包实现了参考文献中描述的微阵列数据随机模型的最大似然估计器的鲁棒变体。该模型包含数据校准(又名归一化)、方差对平均强度的依赖模型和方差稳定数据转换。转换强度之间的差异类似于“归一化对数比”。然而,与后者相比,它们的方差与均值无关,在检测差异转录时通常更敏感和特异。
作者 | 沃尔夫冈·胡贝尔,A. von Heydebreck贡献。其中包括Dennis Kostka、David Kreil、Hans-Ulrich Klein、Robert Gentleman、Deepayan Sarkar和Gordon Smyth等用户的许多评论和建议 |
维护人员 | 沃尔夫冈•休伯 |
要安装这个包,启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“vsn”)
小插曲(文档) |
包下载 |
||||||||||
|
|
biocViews | |
---|---|
取决于 | R,方法,格子,生物基础,affy, limma |
建议 | Affydata, hgu95av2cdf, geneplotter |
进口 | |
SystemRequirements | |
许可证 | 艺术- 2.0 |
URL | http://www.r-project.org, http://www.ebi.ac.uk/huber |
dependsOnMe | Ringo, arrayQualityMetrics, cellHTS2, tilingArray, webbioc |
suggestsMe | bichromodies, GlobalAncova, adSplit, beadarray, cellHTS, ecolitk, globaltest, limma, lumi, twilight |