topGO包提供了测试GO术语的工具,同时考虑GO图的拓扑结构。可以实现和应用不同的测试统计数据和消除GO术语之间的局部相似性和依赖性的不同方法。
作者 | Adrian Alexa, Jorg Rahnenfuhrer |
维护人员 | Adrian Alexa |
要安装这个包,启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“topGO”)
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biocViews | |
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取决于 | R,方法,图形,Biobase, GO.db, AnnotationDbi, SparseM |
建议 | 所有,hgu95av2.db, genfilter, xtable, multtest, Rgraphviz, hgu133a.db |
进口 | 方法,图形,Biobase, SparseM, AnnotationDbi |
SystemRequirements | |
许可证 | LGPL |
URL | |
dependsOnMe | |
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