simpleaffy
非常简单的Affymetrix数据的高级分析
提供高级功能阅读Affy .CEL文件,表型数据,然后计算简单的事情,如t、褶皱等变化。使大量使用affy库。也有一些基本的散点图功能和机制生成高分辨率数字杂志……
| 作者 |
Crispin J•米勒 |
| 维护人员 |
Crispin米勒 |
安装这个包,开始R和输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“simpleaffy”)
细节
| biocViews |
微阵列, OneChannel, 质量控制, 预处理, 转录, DataImport, 统计数据, DifferentialExpression, 注释, ReportWriting, 可视化
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| 取决于 |
R, affy、genefilter Biobase、方法gcrma跑龙套 |
| 建议 |
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| 进口 |
方法,跑龙套 |
| SystemRequirements |
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| 许可证 |
GPL版本2或更高版本 |
| URL |
//www.anjoumacpherson.com, http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/ |
| dependsOnMe |
affyQCReport、arrayQualityMetrics exonmap yaqcaffy |
| suggestsMe |
AffyExpress |