oneChannelGUI

这个包扩展affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3 '看,基因外显子数组实际上是实现togheter Illumina公司,GEO矩阵系列文件和标签分隔的文件。

这个包是简化开发使用Bioconductor工具对初学者有有限或没有经验编写R代码。这个库提供了一个图形界面允许QC,过滤,统计验证和可变剪接分析。

作者 Raffale Calogero,生物信息学和基因组学,临床和生物科学部门都灵(意大利)
维护人员 拉斐尔一Calogero

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“oneChannelGUI”)

小插曲(文档)

包下载
fignew42.pdf
install.pdf
oneChannelGUI.pdf
源 oneChannelGUI_1.6.5.tar.gz
Windows二进制 oneChannelGUI_1.6.5.zip
OS X的二进制 oneChannelGUI_1.6.5.tgz

细节

biocViews
微阵列,OneChannel,DataImport,质量控制,预处理,统计数据,DifferentialExpression,MultipleComparisons
取决于 Biobase、affylmGUI tkWidgets
建议 注释、GOstats genefilter、maSigPro pamr, pdmclass, Rgraphviz, affy, annaffy, affyPLM,乘,ssize, sizepower, siggenes, RankProd org.Hs.eg。db, org.Mm.eg。db, org.Rn.eg。db, metaArray biomaRt、GenomeGraphs AffyCompatible Biostrings
进口
SystemRequirements
许可证 艺术许可证,2.0版
URL http://www.bioinformatica.unito.it/oneChannelGUI/
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