方法可以创建一个简单的微阵列数据库来存储微阵列实验数据和注释。Affymetrix GeneChip表达式值以及值从两个颜色微阵列可以存储到数据库中。整个实验或子集从实验(或也值的子集基因微阵列的一个子集)可以回到r .另外提取方法提供了不同的效用函数等微阵列数据分析函数画马情节或火山地块与数据点颜色编码根据当地点密度或函数,允许复制miroarrays的处理。
作者 | 约翰内斯Rainer |
维护人员 | 约翰内斯Rainer |
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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“方法”)
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biocViews | |
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取决于 | R, Biobase、affy pgUtils limma,方法 |
建议 | geneplotter、annaffy biomaRt |
进口 | |
SystemRequirements | |
许可证 | LGPL版本2或更新 |
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