HOPACH聚类算法通过递归地划分数据集来构建一个簇的层次树，同时在每个级别上对簇进行排序和可能的折叠。该算法使用均值/中值分割轮廓(MSS)准则来识别具有最大同质聚类的树的级别。它还向下运行树以生成元素的最终有序列表。非参数引导允许人们估计每个元素属于每个聚类(模糊聚类)的概率。
| 作者 | 凯瑟琳·s·波拉德和马克·j·范德朗。 |
| 维护人员 | 凯瑟琳·s·波拉德 |
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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“hopach”)
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| biocViews | |
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| 取决于 | R，集群，生物基 |
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| SystemRequirements | |
| 许可证 | GPL版本2或更新 |
| URL | http://www.r-project.org, http://www.stat.berkeley.edu/~laan/， http://docpollard.com/ |
| dependsOnMe | |
| suggestsMe | BiocCaseStudies |