差异基因表达的贝叶斯鲁棒推理

用微阵列数据检测差异表达基因。该包可与cDNA微阵列或Affymetrix芯片一起使用。该包适合一个鲁棒的贝叶斯层次模型测试差分表达式。异常值显式地使用$t$-分布建模。该模型包括一个可交换的方差先验,允许不同的基因方差,但仍然缩小极端经验方差。我们的模型可以用于检测多个样本之间的差异表达基因,并且可以在有三个或更多样本时区分不同可能的差异表达模式。参数估计是使用一种新的马尔可夫链蒙特卡洛进行的,适用于该模型将质量放在全参数空间的子空间上。

作者 拉斐尔Gottardo
维护人员 拉斐尔Gottardo

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“桥”)

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