biomaRt
与BioMart数据库(例如ensemble bl, Wormbase和Gramene)的接口
近年来，在公共数据库中可以获得大量的生物数据。全面的生物信息学数据分析需要方便地获取这些宝贵的数据资源，并与数据分析紧密结合。biomaRt为实现biomaRt软件套件的数据库提供了一个接口(http://www.biomart.org)。该包支持以统一的方式检索大量数据，而不需要知道底层数据库模式或编写复杂的SQL查询。BioMart数据库的例子有ensemble bl、Uniprot、Gramene、Wormbase和HapMap。这些主要数据库使生物art用户可以直接访问各种数据集，并实现从基因注释到数据库挖掘的广泛强大的在线查询。
| 作者 |
Steffen Durinck, Wolfgang Huber, Sean Davis |
| 维护人员 |
史蒂芬Durinck |
要安装这个包，启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biomaRt”)
细节
| biocViews |
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| 取决于 |
方法,RCurl |
| 建议 |
注释 |
| 进口 |
XML |
| SystemRequirements |
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| 许可证 |
艺术- 2.0 |
| URL |
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| dependsOnMe |
GenomeGraphs, affycoretools |
| suggestsMe |
bioccasionally studes, maDB, oneChannelGUI |