affyPLM

探针级模型的拟合方法

扩展和改进基本affy包功能的包。为了提高速度而大量使用已编译代码的例程。重点是实现用于拟合探针级模型的方法和使用这些模型的工具。基于PLM的质量评估工具。

作者 本Bolstad
维护人员 本Bolstad

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affyPLM”)

小插曲(文档)

包下载

AffyExtensions.pdf
MAplots.pdf
QualityAssess.pdf
ThreeStep.pdf
affyPLM_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 affyPLM_1.16.0.zip
OS X二进制文件 affyPLM_1.16.0.tgz

细节

biocViews
取决于 R, affy, Biobase,方法,gcrma, stats, preprocessCore
建议 affydata
进口
SystemRequirements
许可证 GPL版本2或更新
URL http://bmbolstad.com
dependsOnMe RefPlus affyQCReport arrayQualityMetrics
suggestsMe AffyExpress, bioccudies, affylmGUI, oneChannelGUI