用于解析Affymetrix文件的包(CDF, CEL, CHP, BPMAP, BAR)。它使用Affymetrix的Fusion SDK提供了快速和内存高效解析Affymetrix文件的方法。支持基于ASCII和二进制的文件。目前,有读取芯片定义文件(CDF)和单元强度文件(CEL)的方法。这些文件可以全部读取,也可以部分读取。例如,可以非常快速地从一组CEL文件中提取来自几个探测集的探测信号到一个方便的列表结构中。
作者 | 亨里克·本特森,詹姆斯·布拉德,卡斯珀·丹尼尔·汉森 |
维护人员 | 卡斯珀·丹尼尔·汉森 |
要安装这个包,启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affxparser”)
小插曲(文档) |
包下载 |
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biocViews | |
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取决于 | R |
建议 | R.utils, AffymetrixDataTestFiles |
进口 | |
SystemRequirements | |
许可证 | LGPL-2 |
URL | |
dependsOnMe | 低聚糖,pdInfoBuilder |
suggestsMe |