affxparser

Affymetrix文件解析SDK

用于解析Affymetrix文件的包(CDF, CEL, CHP, BPMAP, BAR)。它使用Affymetrix的Fusion SDK提供了快速和内存高效解析Affymetrix文件的方法。支持基于ASCII和二进制的文件。目前,有读取芯片定义文件(CDF)和单元强度文件(CEL)的方法。这些文件可以全部读取,也可以部分读取。例如,可以非常快速地从一组CEL文件中提取来自几个探测集的探测信号到一个方便的列表结构中。

作者 亨里克·本特森,詹姆斯·布拉德,卡斯珀·丹尼尔·汉森
维护人员 卡斯珀·丹尼尔·汉森

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affxparser”)

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包下载

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affxparser_1.12.2.tar.gz
Windows二进制 affxparser_1.12.2.zip
OS X二进制文件 affxparser_1.12.2.tgz

细节

biocViews
取决于 R
建议 R.utils, AffymetrixDataTestFiles
进口
SystemRequirements
许可证 LGPL-2
URL
dependsOnMe 低聚糖,pdInfoBuilder
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