VanillaICE

SNP芯片数据的隐马尔可夫模型拟合方法

用于表征高通量SNP阵列中染色体改变的隐马尔科夫模型

作者 Robert Scharpf和Ingo Ruczinski
维护人员 罗伯特Scharpf

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“VanillaICE”)

小插曲(文档)

包下载

IlluminaHowTo.pdf
VanillaICE.pdf
VanillaICE_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 VanillaICE_1.2.0.zip
OS X二进制文件 VanillaICE_1.2.0.tgz

细节

biocViews
取决于 R, SNPchip, oligoClasses, Biobase
建议 RColorBrewer, genfilter, RSQLite
进口
SystemRequirements
许可证 LGPL-2
URL http://www.biostat.jhsph.edu/~rscharpf/software/index.html
dependsOnMe
suggestsMe SNPchip