RLMM

非对称SNP阵列的基因型调用算法

一种基于多芯片、多SNP方法的Affymetrix SNP阵列分类算法。利用已知基因型标签的大型训练样本,该算法将在新数据上获得更准确的分类结果。RLMM基于稳健的线性模型,并使用马氏距离进行分类。通过归一化去除芯片之间的非生物变异。这种基于模型的算法捕捉了基因型组和探针之间的相似性,以及数千个其他snp的精确分类。注意:100K-Xba目前仅在。

作者 Nusrat Rabbee, Gary Wong报道
维护人员 Nusrat Rabbee

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RLMM”)

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细节

biocViews
取决于 R,质量
建议
进口
SystemRequirements 内部文件Xba。CQV Xba。区域(或其他区域文件)
许可证 LGPL版本2或更新版本
URL http://www.stat.berkeley.edu/users/nrabbee/RLMM
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