GlobalAncova

计算组间差异基因表达的全局测试

我们给出了以下支持GlobalAncova方法的论据:经过适当的规范化，基因表达数据看起来相当对称，异常值不是真正的问题，因此最小二乘法应该相当稳健。具有交互作用的ANCOVA产生饱和的数据建模，例如每个群体和基因的不同均值。协变量调整有助于纠正可能的选择偏差。不能期望方差同质性和不相关残差。普通最小二乘的应用给出无偏的，但不再是最优估计(高斯-马尔可夫-艾特肯)。因此，由于相关性，使用经典的f检验是不合适的。然而，检验统计量反映了零假设的偏差。结合排列方法，经验显著性水平可以近似。或者，近似产生渐近p值。这项工作得到了德国BMBF NGFN基金01 GR 0459的支持。

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GlobalAncova”)

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