基因组数据分析需要已知基因组信息和新的实验数据的集成可视化。GenomeGraphs使用biomaRt包对Ensembl执行实时注释查询,并将其转换为网格图形包的视口中的基因/转录本结构。这将导致基因组信息与您的数据一起绘制。GenomeGraphs的另一个优点是可以将不同的数据类型,如阵列CGH、基因表达、测序和其他数据,一起绘制在一个图中,使用相同的基因组坐标系统。
作者 | 史蒂芬·杜林克,詹姆斯·布拉德 |
维护人员 | 史蒂芬Durinck |
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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GenomeGraphs”)
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biocViews | |
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取决于 | 方法,生物技术,网格 |
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许可证 | 艺术- 2.0 |
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suggestsMe | oneChannelGUI |