GEOquery

从NCBI基因表达Omnibus (GEO)获取数据

NCBI基因表达Omnibus (GEO)是微阵列数据的公共存储库(200,000个实验)。考虑到这些数据的丰富性和多样性,将BioConductor工具应用于这些数据是很自然的。GEOquery是GEO和BioConductor之间的桥梁。

作者 肖恩·戴维斯
维护人员 肖恩·戴维斯

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GEOquery”)

小插曲(文档)

包下载

GEOquery.pdf
GEOquery_2.4.5.tar.gz
Windows二进制 GEOquery_2.4.1.zip
OS X二进制文件 GEOquery_2.4.5.tgz

细节

biocViews
取决于 方法,Biobase, RCurl
建议 limma
进口
SystemRequirements
许可证 GPL版本2
URL
dependsOnMe GEOmetadb
suggestsMe PGSEA