NCBI基因表达综合(GEO)是最大的微阵列数据公共存储库。然而，使用现有工具查找感兴趣的数据可能具有挑战性。GEOmetadb试图使访问与示例、平台和数据集相关的元数据更加可行。这是通过将所有NCBI GEO元数据解析为一个SQLite数据库来实现的，该数据库可以在本地存储和查询。GEOmetadb只是SQLite数据库及其相关文档的一个薄包装。最后，随着新数据被添加到GEO, SQLite数据库会定期更新，并且可以随时下载最新的元数据。
| 作者 | 杰克朱和肖恩戴维斯 |
| 维护人员 | 杰克朱 |
要安装这个包，启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GEOmetadb”)
小插曲(文档) |
包下载 |
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| biocViews | |
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| 取决于 | GEOquery, RSQLite |
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| SystemRequirements | |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| URL | http://meltzerlab.nci.nih.gov/apps/geo, http://gbnci.abcc.ncifcrf.gov/geo/ |
| dependsOnMe | |
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