Biostrings

表示生物序列的字符串对象,以及匹配算法

内存高效的字符串容器,字符串匹配算法和其他实用程序,用于快速操作大型生物序列或序列集。

作者 H.佩奇,R. Gentleman, P. Aboyoun和S. DebRoy
维护人员 h .页面

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Biostrings”)

小插曲(文档)

包下载

Alignments.pdf
Biostrings2Classes.pdf
DNAStringVectorization.pdf
GenomeSearching.pdf
Biostrings_2.8.18.tar.gz
Windows二进制 Biostrings_2.8.18.zip
OS X二进制文件 Biostrings_2.8.18.tgz

细节

biocViews
取决于 R,方法,统计
建议 BSgenome BSgenome.Celegans.UCSC。ce2 BSgenome.Dmelanogaster.UCSC。dm3, drosophila2probe, hgu95av2probe, RUnit
进口 方法,统计数据
SystemRequirements
许可证 艺术- 2.0
URL
dependsOnMe BSgenome, GGtools, altcdfenvs
suggestsMe 注释,oneChannelGUI, rtracklayer