| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| AffyExpress | 李学军 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma包进行affy分析的GUI |
| affyPLM | 本Bolstad | 探针级模型的拟合方法 |
| affyQCReport | 克雷格Parman | 为affyBatch对象生成QC报告 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 备选CDF环境(又名映射) |
| arrayQuality | 艾格尼丝Paquet | 评估点状阵列上的阵列质量 |
| arrayQualityMetrics | 奥黛丽考夫曼 | 微阵列数据集的质量度量 |
| beadarray | 马克·邓宁 | Illumina BeadArray数据的质量评估和底层分析 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | 用于limma包的GUI |
| 庄园 | 皮埃尔Neuvial | CGH微阵列归一化 |
| 奥林 | 马提亚Futschik | 优化的局部强度相关的双色微阵列归一化 |
| OLINgui | 马提亚Futschik | OLIN的图形用户界面 |
| oneChannelGUI | Raffaele A Calogero | 这个包扩展了affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3’IVT，基因外显子阵列实际与Illumina、GEO矩阵系列文件和制表符分隔文件一起实现。 |
| 罗摩 | 拉斐尔Gottardo | 微阵列的稳健分析 |
| 林格 | j . Toedling | R NimbleGen寡聚阵列的研究 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| spikeLI | 恩里科Carlon | Affymetrix刺入Langmuir等温线数据分析工具 |
| spotSegmentation | 克里斯Fraley | 微阵列光斑块的分割与网格化 |
| yaqcaffy | 劳伦特与 | Affymetrix表达数据质量控制及再现性分析 |