包 | 维护人员 | 标题 |
---|---|---|
aCGH | 简Fridlyand | 阵列比较基因组杂交数据的类和函数。 |
affxparser | 卡斯珀·丹尼尔·汉森 | Affymetrix文件解析SDK |
affyio | 本杰明·米洛·博尔斯塔德 | 用于解析Affymetrix数据文件的工具 |
affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma包进行affy分析的GUI |
beadarraySNP | 1月东 | Illumina SNP珠阵列的规范化和报告 |
codelink | 迭戈Diez | Codelink生物阵列数据的操作。 |
ctc | 安东尼·卢卡斯 | 集群和树转换。 |
exonmap | Crispin米勒 | Affymetrix外显子阵列数据的高水平分析 |
GEOquery | 肖恩·戴维斯 | 从NCBI基因表达Omnibus (GEO)获取数据 |
limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
limmaGUI | 基斯Satterley | 用于limma包的GUI |
makecdfenv | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | CDF环境生成器 |
庄园 | 皮埃尔Neuvial | CGH微阵列归一化 |
oneChannelGUI | Raffaele A Calogero | 这个包扩展了affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3’IVT,基因外显子阵列实际与Illumina、GEO矩阵系列文件和制表符分隔文件一起实现。 |
林格 | j . Toedling | R NimbleGen寡聚阵列的研究 |
SAGx | 每Broberg | 基因芯片的统计分析 |
simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |