# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked”)

这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked。

完整的蒙面基因组序列背带吊裤带(galGal4 UCSC的版本)

Bioconductor版本:2.14

完整的基因组序列背带吊裤带(鸡)提供的UCSC (galGal4, 2011年11月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Ggallus.UCSC序列是一样的。galGal4,除了他们每个人上面具后的4:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具),(3)重复的面具RepeatMasker (RM面具),和(4)串联重复序列的重复的面具仪(扶轮基金会面具)。只有AGAPS和AMB面具默认是“活跃”的。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

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文档

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细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,Gallus_gallus,遗传学
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4
进口	BSgenome,BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4
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包档案

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包的来源	BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制	BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked_1.3.99.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked_1.3.99.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked_1.3.99.tgz
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked/
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