安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“sangerseqR”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sangerseqR。
Bioconductor版本:2.14
这个包包含几个工具分析R Sanger测序数据文件,包括阅读.scf和.ab1文件,使basecalls和图绘制色谱图。
作者:乔纳森·t·希尔,布拉德利Demarest
乔纳森·希尔在genetics.utah.edu < jhill维护者:>
从内部引用(R,回车引用(“sangerseqR”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“sangerseqR”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“sangerseqR”)
R脚本 | sangerseqR | |
参考手册 |
biocViews | 单核苷酸多态性,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(2年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.0.2),Biostrings |
进口 | 方法 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | sangerseqR_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | sangerseqR_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | sangerseqR_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | sangerseqR_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/sangerseqr/tree/release - 2.14 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/sangerseqR/ |
包下载报告 | 下载数据 |