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此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见rTANDEM．

串联蛋白识别算法的接口

Bioconductor版本:2.14

本包接口串联蛋白识别算法在r中，可在X中启动识别!串联式，通过使用参数文件的路径作为唯一参数。但是rTANDEM也提供了扩展的语法和函数来简化启动分析，以及将结果、参数和分类法转换为r的函数。一个相关的包shinyTANDEM提供了结果对象的可视化接口。

作者:弗雷德里克·富尼耶<弗雷德里克。在crchuq. ulval .ca>，Charles Joly Beauparlant , Rene Paradis , Arnaud Droit

维护者:Frederic Fournier < Frederic。在crchuq. ulval .ca>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rTANDEM”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rTANDEM”)

PDF	R脚本	rTANDEM用户指南
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	artist -1.0 |文件许可
取决于	XML，Rcpp，data.table(> = 1.8.8)
进口	方法
链接	Rcpp
建议	biomaRt
SystemRequirements	rTANDEM使用expat和pthread库。有关详细信息，请参阅README文件。
增强了
URL
全靠我	sapFinder，shinyTANDEM
进口我
建议我	RforProteomics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	rTANDEM_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	rTANDEM_1.4.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	rTANDEM_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	rTANDEM_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/rTANDEM/tree/release-2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rTANDEM/
软件包下载报告	下载数据