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此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见rSFFreader．

rSFFreader读取由罗氏454和生命科学离子激流测序器生成的sff文件

Bioconductor版本:2.14

rSFFreader从罗氏454和生命科学离子激流测序器生成的sff文件中读取序列，质量和剪辑点值。该计划还将写入sff文件，并使用一些utils读取流程图

作者:Matt settle ， Sam Hunter, Brice Sarver, Ilia Zhbannikov, Kyu-Chul Cho

维护者:Matt settle

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rSFFreader”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rSFFreader”)

PDF	R脚本	rSFFreader的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，测序，软件
版本	0.12.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.13.0)，BiocGenerics，IRanges(> = 1.21.10),XVector(> = 0.3.2),Biostrings(> = 2.31.3),GenomicRanges，ShortRead(> = 1.15.9),xtable、方法
进口	方法,IRanges，XVector，Biostrings，ShortRead，GenomicRanges，Biobase
链接	IRanges，XVector，Biostrings
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	rSFFreader_0.12.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	rSFFreader_0.12.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	rSFFreader_0.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/rSFFreader/tree/release-2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rSFFreader/
软件包下载报告	下载数据