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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅nem。

(动态的)嵌套效应模型和确定性效应传播网络重建表型层次结构

Bioconductor版本:2.14

包的nem允许嵌套结构的重构路径的特点扰动的影响。需要作为输入(1)一组路径组件,深感不安,(2)表型读出这些扰动(如基因表达、蛋白表达)。输出是一个有向图表示表型层次结构。

作者:Holger Froehlich、Florian Markowetz Achim Tresch,特蕾莎Niederberger,基督教本德,马提亚Maneck,克劳迪奥Lottaz,蒂姆Beissbarth

维修工:Holger Froehlich < frohlich在bit.uni-bonn.de >

安装

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browseVignettes (nem)

PDF	R脚本	嵌套模型——一个例子在果蝇免疫反应的影响
PDF		参考手册

细节

biocViews	GraphAndNetwork,微阵列,通路,软件
版本	2.38.0
Bioconductor自	BioC 1.9 (r - 2.4)(9.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.0),e1071(> = 1.5),图(> = 1.24),plotrix,limma,集群(> = 1.11),statmod,Hmisc,Rgraphviz
进口	引导,e1071,图、图形grDevices、方法RBGL(> = 1.8.1),RColorBrewer,统计,跑龙套,Rgraphviz
链接
建议	Biobase(> = 1.10)
SystemRequirements
增强了	doMC,Rglpk
URL	//www.anjoumacpherson.com
取决于我	lpNet
进口我
建议我	rBiopaxParser
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	nem_2.38.0.tar.gz
Windows二进制	nem_2.38.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	nem_2.38.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	nem_2.38.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/nem/tree/release - 2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/nem/
包下载报告	下载数据