要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“motifStack”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

motifStack

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见motifStack

绘制单个或多个DNA、RNA和氨基酸序列的堆叠logo

Bioconductor版本:2.14

motifStack包是为具有不同相似性分数的多个图案的图形表示而设计的。它适用于DNA/RNA序列motif和氨基酸序列motif。此外,它还为用户提供了自定义字体类型和符号颜色等图形参数的灵活性。

作者:欧建宏,Michael Brodsky, Scot Wolfe,朱丽华

维护者:欧建宏<建宏。你在umassmed。edu>

引文(从R内,输入引用(“motifStack”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“motifStack”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“motifStack”)

PDF R脚本 motifStack装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GenomicsSequenceSequenceMatching软件可视化
版本 1.8.1
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 2.15.1),方法,grImport、网格MotIVade4
进口 XML
链接
建议 RUnitBiocGenericsMotifDbRColorBrewerBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 dagLogo
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 motifStack_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 motifStack_1.8.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) motifStack_1.8.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) motifStack_1.8.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/motifStack/tree/release-2.14
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/motifStack/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心