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此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见htSeqTools．

高通量测序数据的质量控制、可视化和处理

Bioconductor版本:2.14

我们提供高效、易用的高通量测序工具(ChIP-seq, RNAseq等)。这些包括MDS图(类似于PCA)，检测低效的免疫沉淀或过度扩增的伪影，识别和测试具有大量reads积累的基因组区域的工具，以及覆盖剖面的可视化。

作者:evalist Planet, Camille Stephan-Otto, Oscar Reina, Oscar Flores, David Rossell

维护者:Oscar Reina < Oscar。雷纳在irbbarcelona.org>

安装

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文档

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PDF	R脚本	htSeqTools库手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	质量控制，测序，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 2.12.2)，方法，BiocGenerics(> = 0.1.0),Biobase，IRanges、方法、质量，BSgenome，GenomicRanges
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了	多核
URL
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建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	htSeqTools_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	htSeqTools_1.10.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	htSeqTools_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	htSeqTools_1.10.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/htSeqTools/tree/release-2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/htSeqTools/
软件包下载报告	下载数据