##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ggbio”)

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见ggbio．

基因组数据的可视化工具。

Bioconductor版本:2.14

ggbio包扩展并专门化了生物数据的图形语法。这些图表旨在回答常见的科学问题，特别是那些经常被问到的高通量基因组数据。在适当的情况下，支持所有核心Bioconductor数据结构。该软件包支持特定基因组区域的详细视图，以及全基因组概述。支持的概览包括表意文字和大线性视图。高级图包括序列片段长度、到数据视图的边链接间隔、不匹配堆积和几个拼接摘要。

作者:尹腾飞，戴安·库克，迈克尔·劳伦斯

维护者:尹腾飞<尹腾飞at gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ggbio”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ggbio”)

PDF	R脚本	第0部分:介绍和快速入门
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,软件,可视化
版本	1.12.10
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics,ggplot2(> = 1.0.0)
进口	网格，grDevices，图形，统计，utils，biovizBase(> = 1.12.1),reshape2,gtable,Biobase,IRanges(> = 1.21.19),GenomicRanges(> = 1.13.3),GenomicFeatures,Rsamtools(> = 1.13.1),GenomicAlignments,BSgenome,gridExtra,尺度,VariantAnnotation,Hmisc,rtracklayer,Biostrings
链接
建议	vsn,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,chipseq,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,knitr,BiocStyle,Homo.sapiens
SystemRequirements
增强了
URL	http://tengfei.github.com/ggbio/
全靠我	咖啡馆,intansv
进口我	Rariant,ReportingTools,SomaticSignatures
建议我	beadarray,gwascat,interactiveDisplay,SomaticCancerAlterations
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	ggbio_1.12.10.tar.gz
Windows二进制	ggbio_1.12.10.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ggbio_1.12.10.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	ggbio_1.12.10.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/ggbio/tree/release-2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ggbio/
软件包下载报告	下载数据