要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“dyebias”)
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此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见dyebias.
Bioconductor版本:2.14
许多双色杂交都有基因特异性和载玻片特异性的染料偏倚。前者取决于用于标记的核苷酸的含量;后者取决于贴标签的百分比。到目前为止,还没有认识到幻灯片依赖性,因此不可能处理人工制品。给定合理数量的染料交换杂交对,或相同杂交对相同杂交,可以使用GASSCO方法估计和纠正基因和滑动偏倚(Margaritis et al., Mol. Sys。生物学报。5:266 (2009),doi:10.1038/msb.2009.21)
作者:Philip Lijnzaad和Thanasis Margaritis
维护者:Philip Lijnzaad
引文(从R内,输入引用(“dyebias”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“dyebias”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“dyebias”)
R脚本 | 偏染校正 | |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | 微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 2.4 (R-2.9)(7年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 1.4.1),marray,Biobase |
进口 | |
链接 | |
建议 | limma,转换,GEOquery,dyebiasexamples、方法 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.holstegelab.nl/publications/margaritis_lijnzaad |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | dyebiasexamples |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | dyebias_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | dyebias_1.22.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | dyebias_1.22.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | dyebias_1.22.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/dyebias/tree/release-2.14 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/dyebias/ |
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