要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“dyebias”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

dyebias

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见dyebias

修正滑动依赖基因特异性染料偏倚的GASSCO方法

Bioconductor版本:2.14

许多双色杂交都有基因特异性和载玻片特异性的染料偏倚。前者取决于用于标记的核苷酸的含量;后者取决于贴标签的百分比。到目前为止,还没有认识到幻灯片依赖性,因此不可能处理人工制品。给定合理数量的染料交换杂交对,或相同杂交对相同杂交,可以使用GASSCO方法估计和纠正基因和滑动偏倚(Margaritis et al., Mol. Sys。生物学报。5:266 (2009),doi:10.1038/msb.2009.21)

作者:Philip Lijnzaad和Thanasis Margaritis

维护者:Philip Lijnzaad

引文(从R内,输入引用(“dyebias”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“dyebias”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“dyebias”)

PDF R脚本 偏染校正
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews 微阵列预处理质量控制软件TwoChannel
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 1.4.1),marrayBiobase
进口
链接
建议 limma转换GEOquerydyebiasexamples、方法
SystemRequirements
增强了
URL http://www.holstegelab.nl/publications/margaritis_lijnzaad
全靠我
进口我
建议我 dyebiasexamples
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 dyebias_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 dyebias_1.22.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) dyebias_1.22.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) dyebias_1.22.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/dyebias/tree/release-2.14
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/dyebias/
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文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心