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此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见crlmm．

用于Affymetrix SNP 5.0和6.0和Illumina阵列的基因型呼叫(CRLMM)和拷贝数分析工具。

Bioconductor版本:2.14

更快地实现特定于SNP 5.0和6.0阵列的CRLMM，以及特定于5.0、6.0和Illumina平台的拷贝号工具

作者:Benilton S Carvalho, Robert Scharpf, Matt Ritchie, Ingo Ruczinski, Rafael A Irizarry

维护者:Benilton S Carvalho ， Robert Scharpf ， Matt Ritchie

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“crlmm”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“crlmm”)

PDF	R脚本	拷贝数估计
PDF	R脚本	小插图-下游分析
PDF	R脚本	crlmm Vignette -基因分型
PDF	R脚本	拷贝数分析的基础设施
PDF	R脚本	拷贝数小插图概述
PDF	R脚本	用于拷贝数分析的Illumina阵列预处理和基因分型
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，预处理，单核苷酸多态性，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.14.0)，oligoClasses(> = 1.21.12),preprocessCore(> = 1.17.7)
进口	方法,Biobase(> = 2.15.4),BiocGenerics，affyio(> = 1.23.2),illuminaio，椭圆，mvtnorm，样条，统计，SNPchip跑龙套,晶格，ff，foreach，RcppEigen(> = 0.3.1.2.1),matrixStats，VGAM
链接	preprocessCore(> = 1.17.7)
建议	hapmapsnp6，genomewidesnp6Crlmm(> = 1.0.7),GGdata，snpStats，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	ArrayTV，hapmap370k，oligoClasses，SNPchip
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	crlmm_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	crlmm_1.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	crlmm_1.22.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	crlmm_1.22.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/crlmm/tree/release-2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/crlmm/
软件包下载报告	下载数据