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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅compcodeR。

RNAseq数据模拟、微分表达式分析和微分表达式方法的性能比较

Bioconductor版本:2.14

这个包提供了广泛的功能,比较不同方法获得的结果微分表达式RNAseq数据的分析。它还包含函数模拟计算数据和接口为执行微分表达式分析几个包。

作者:夏洛特Soneson

维护人员:夏洛特Soneson <夏洛特。在isb-sib.ch Soneson >

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PDF	R脚本	compcodeR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,RNASeq,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(2年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0.2),sm
进口	tcltk,knitr(> = 1.2),减价,ROCR,晶格(> = 0.16),gplots,gtools,gdata,caTools、网格KernSmooth,质量,ggplot2,stringr,模式,刨边机,limma,vioplot、方法
链接
建议	BiocStyle,EBSeq,DESeq,DESeq2(> = 1.1.31),baySeq(> = 1.16.0),genefilter,NOISeq,DSS,移行细胞癌,samr,NBPSeq,HTSDiff
SystemRequirements
增强了	rpanel
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	compcodeR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	compcodeR_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	compcodeR_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	compcodeR_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/compcoder/tree/release - 2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/compcodeR/
包下载报告	下载数据