要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biovizBase”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

biovizBase

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见biovizBase

基因组数据可视化的基本图形实用程序。

Bioconductor版本:2.14

biovizBase包旨在为基因组数据提供一套实用程序、配色方案和约定。它是生物数据可视化的各种高级包的基础。这节省了开发工作并鼓励一致性。

作者:尹腾飞,迈克尔·劳伦斯,黛安·库克

维护者:尹腾飞<尹腾飞at gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“biovizBase”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biovizBase”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“biovizBase”)

PDF R脚本 biovizBase简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施预处理软件可视化
版本 1.12.3
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.10),方法
进口 methods, grDevices, stats,尺度HmiscRColorBrewer二色视者BiocGenericsIRangesGenomicRanges(> = 1.13.3),BiostringsRsamtools(> = 1.13.1),GenomicAlignmentsGenomicFeaturesAnnotationDbiVariantAnnotation
链接
建议 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneBSgenomertracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 咖啡馆qrqc
进口我 ggbioGvizqrqc
建议我 Rariant
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 biovizBase_1.12.3.tar.gz
Windows二进制 biovizBase_1.12.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) biovizBase_1.12.3.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) biovizBase_1.12.3.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/biovizBase/tree/release-2.14
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/biovizBase/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心