要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“VariantTools”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

VariantTools

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见VariantTools

研究遗传变异的工具

Bioconductor版本:2.14

用于检测、过滤、调用、比较和绘制变量的工具。

作者:Michael Lawrence, Jeremiah Degenhardt, Robert Gentleman

维护者:Michael Lawrence

引文(从R内,输入引用(“VariantTools”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“VariantTools”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“VariantTools”)

PDF R脚本 VariantTools简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneticVariability遗传学测序软件
版本 1.6.1
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 IRanges(> = 1.19.34),GenomicRanges(> = 1.13.43),VariantAnnotation(>= 1.7.35),方法
进口 Rsamtools(> = 1.11.10),BiocGenericsBiostrings平行,gmapR(> = 1.5.15),GenomicFeatures矩阵rtracklayerBiocParallelGenomeInfoDb
链接
建议 RUnitLungCancerLines(> = 0.0.6),RBGL
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 HTSeqGenie
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 VariantTools_1.6.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/VariantTools/tree/release-2.14
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/VariantTools/
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文档»

Bioconductor

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