要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TargetScore”)

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TargetScore

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见TargetScore

TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标

Bioconductor版本:2.14

通过概率模拟microRNA过表达折叠变化的可能性和基于序列的分数,推断microRNA目标的后验分布。采用变向贝叶斯高斯混合模型(VB-GMM)记录折叠变化和序列分数,得到潜在变量作为miRNA靶标的后验。最终的targetScore计算为sigmoid转换的折叠变化,由所有特征的目标组件的平均后视进行加权。

作者:李越

维护者:Yue Li

引文(从R内,输入引用(“TargetScore”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TargetScore”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TargetScore”)

PDF R脚本 TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件microrna的
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 pracma矩阵
进口
链接
建议 TargetScoreDatagplotsBiobaseGEOquery
SystemRequirements
增强了
URL http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/software.html
全靠我
进口我
建议我 TargetScoreData
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 TargetScore_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 TargetScore_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) TargetScore_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) TargetScore_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/TargetScore/tree/release-2.14
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TargetScore/
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