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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TFBSTools。

软件包的转录因子结合位点(TFBS)分析

Bioconductor版本:2.14

TFBSTools包是一个转录因子结合位点的分析和操纵和转录因子矩阵。

作者:通用电气Tan <通用电气。在imperial.ac.uk tan09 >

维护人员:通用电气Tan <通用电气。在imperial.ac.uk tan09 >

安装

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文档

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PDF	R脚本	TFBSTools
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneRegulation,MotifAnnotation,MotifDiscovery,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.0.1)
进口	Biostrings(> = 2.29.19),RSQLite(> = 0.11.4),seqLogo,GenomicRanges(> = 1.13.50),caTools(> = 1.14),XVector(> = 0.2.0),rtracklayer(> = 1.22.0),BSgenome(> = 1.30.0),IRanges(> = 1.19.38)、方法gtools(> = 3.0.0),cn(> = 0.99.8),BiocParallel(> = 0.5.6),DirichletMultinomial(> = 1.5.1)
链接
建议	JASPAR2014(> = 0.99.3),RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements	meme
增强了
URL	http://jaspar.genereg.net/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	TFBSTools_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	TFBSTools_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	TFBSTools_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	TFBSTools_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/tfbstools/tree/release - 2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TFBSTools/
包下载报告	下载数据