要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SANTA”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见圣诞老人.
Bioconductor版本:2.14
该软件包提供了测量网络和表型之间的关联强度的方法。它通过测量整个网络中表型的聚类来做到这一点。顶点还可以根据它们与高权重顶点的关联强度单独排名。
作者:Alex Cornish和Florian Markowetz
引文(从R内,输入引用(“圣诞老人”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SANTA”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“圣诞老人”)
R脚本 | 使用圣 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,网络,NetworkEnrichment,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(3年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.14),igraph |
进口 | 矩阵,二甲基砜,雪 |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,org.Sc.sgd.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | SANTA_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | SANTA_1.4.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | SANTA_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | SANTA_1.4.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/SANTA/tree/release-2.14 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SANTA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |