要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RMassBank”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

RMassBank

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见RMassBank

处理串联MS文件和构建MassBank记录的工作流

Bioconductor版本:2.14

处理串联MS文件和构建MassBank记录的工作流。功能包括串联质谱的自动提取、串联质谱片段的公式分配、用指定片段重新校准串联质谱、谱清理、从互联网数据库中自动检索化合物信息以及导出到MassBank记录。

作者:Michael Stravs, Emma Schymanski, Steffen Neumann, Erik Mueller,由Tobias Schulze提供

维护者:RMassBank at Eawag

引文(从R内,输入引用(“RMassBank”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RMassBank”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RMassBank”)

PDF R脚本 RMassBank非标准用法
PDF R脚本 RMassBank使用XCMS演练
PDF R脚本 RMassBank预排
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学MassSpectrometry代谢组学软件
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Rcpp
进口 XMLRCurlrjsonrcdkyamlmzR、方法
链接
建议 gplotsRMassBankDataxcms(> = 1.37.1),相机ontoCATRUnit
SystemRequirements OpenBabel
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 RMassBankData
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 RMassBank_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 RMassBank_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) RMassBank_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) RMassBank_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/RMassBank/tree/release-2.14
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RMassBank/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心