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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅QDNAseq。

定量DNA测序染色体畸变

Bioconductor版本:2.14

定量DNA测序染色体畸变。

作者:Ilari谢宁

维护人员:Ilari谢宁< Ilari。谢宁gmail.com >

安装

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文档

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browseVignettes (“QDNAseq”)

PDF	R脚本	介绍QDNAseq
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation,DNASeq,遗传学,GenomeAnnotation,预处理,质量控制,测序,软件
版本	1.0.5
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(2年)
许可证	GPL
取决于	R (> = 2.15.0)
进口	图形、方法、统计跑龙套,matrixStats(> = 0.9.4),R.utils(> = 1.28.4),Biobase(> = 2.18.0),CGHbase(> = 1.18.0),CGHcall(> = 2.18.0),DNAcopy(> = 1.32.0),Rsamtools(> = 1.10.0)
链接
建议	R.cache(> = 0.9.0),消化,降雪,BSgenome,GenomeInfoDb,GenomicRanges
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ccagc/QDNAseq
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	QDNAseq_1.0.5.tar.gz
Windows二进制	QDNAseq_1.0.5.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	QDNAseq_1.0.5.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	QDNAseq_1.0.5.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/qdnaseq/tree/release - 2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/QDNAseq/
包下载报告	下载数据