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要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“PGSEA”)
在大多数情况下，您根本不需要下载包存档。
PGSEA
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此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见PGSEA．
参数基因集富集分析
Bioconductor版本:2.14
基因集富集的参数分析
作者:Kyle Furge < Kyle。furge在vai.org>和Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>
维护者:Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>
引文(从R内，输入引用(“PGSEA”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“PGSEA”)
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“PGSEA”)
| R脚本 | HOWTO: PGSEA | |
| R脚本 | PGSEA示例工作流 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 微阵列，软件 |
| 版本 | 1.38.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.0 (R-2.5)(9年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 2.10)，GO.db，KEGG.db，AnnotationDbi，annaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | GSEABase，GEOquery，org.Hs.eg.db，hgu95av2.db，limma |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | GeneExpressionSignature |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 包的来源 | PGSEA_1.38.0.tar.gz |
| Windows二进制 | PGSEA_1.38.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | PGSEA_1.38.0.tgz |
| Mac OS X 10.9 (Mavericks) | PGSEA_1.38.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/PGSEA/tree/release-2.14 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PGSEA/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
