要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MiRaGE”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

海市蜃楼

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见海市蜃楼

MiRNA基因表达排序

Bioconductor版本:2.14

该包包含的功能推断靶基因调控miRNA,仅基于靶基因表达谱。

作者:Y-h。田口<标签在granular.com>

维护人员:Y-h。田口<标签在granular.com>

引文(从R内,输入引用(“海市蜃楼”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MiRaGE”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“海市蜃楼”)

PDF R脚本 如何使用MiRaGE Package
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneExpression微阵列RNASeqRNAseqData圣人测序软件
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 GPL
取决于 R (>= 3.1.0),Biobase(> = 2.23.3)
进口 AnnotationDbiBiocGenerics
链接
建议 seqinr(> = 3.0.7),biomaRt(> = 2.19.1),GenomicFeatures(> = 1.15.4),Biostrings(> = 2.31.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10miRNATargethumanStemCellIRangesGenomicRanges(> = 1.8.3),BSgenomebeadarrayExampleData
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 MiRaGE_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 MiRaGE_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) MiRaGE_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) MiRaGE_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/MiRaGE/tree/release-2.14
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MiRaGE/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心