要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MMDiff”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

MMDiff

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见MMDiff

ChIP-Seq数据集的统计检验

Bioconductor版本:2.14

该包检测了不同ChIP-Seq样本中读富集配置文件之间的统计显著差异。为了利用形状差异,它使用了核方法(最大平均差异,MMD)。

作者:Gabriele Schweikert

维护者:Gabriele Schweikert

引文(从R内,输入引用(“MMDiff”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MMDiff”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MMDiff”)

PDF R脚本 使用“MMDiff”包分析ChIP-Seq数据
PDF 参考手册

细节

biocViews ChIPSeqMultipleComparison软件
版本 1.4.1
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.14.0),GenomicRanges平行,DiffBindGMDRsamtools
进口 GenomicRangesIRangesBiobase
链接
建议 MMDiffBamSubset
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 MMDiffBamSubset
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 MMDiff_1.4.1.tar.gz
Windows二进制 MMDiff_1.4.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) MMDiff_1.4.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) MMDiff_1.4.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/MMDiff/tree/release-2.14
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MMDiff/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心